Archive

2026-01-17

文献--单细胞组学大模型之Nicheformer

文献-算法
2026-01-09

文献--利用纳米孔长读长测序进行单细胞和空间可变剪接分析

文献-组学 神经蛙的藏宝阁
2025-12-20

文献--单细胞扰动预测模型Benchmark

文献-算法
2025-12-12

文献--使用短读长和长读长RNA测序方法阐明RNA加工的协调性

文献-组学 神经蛙的藏宝阁
2025-10-04

Adobe Illustrator快速入门

科研技能
2025-08-17

linux秘钥登录

Linux
2025-08-04

Python-可视化-sns绘制回归点图

Python
2025-07-28

Python-可视化-sns绘制热图&聚类热图

Python
2025-07-27

MAGeCK-VISPR质控分析CRISPR测序数据

转录组
2025-07-22

gseapy富集分析与可视化

转录组
2025-07-14

Python-可视化-statannotations包为sns绘图注释显著性

Python
2025-07-01

linux设备挂载mount

Linux
2025-06-25

基因-蛋白-化合物ID转换

生信基础 化合物
2025-04-18

Faiss向量数据库相似搜索

深度学习
2025-04-04

Python-可视化-seaborn(sns)绘图基础

Python
2025-01-24

Hugging face(4) Bert模型及Collator与Trainer

深度学习
2025-01-23

Gene2vec算法根据基因对计算基因表示

深度学习
2025-01-23

Python-tdigest分位数统计

Python
2025-01-18

文献--单细胞组学大模型之Geneformer V2[预印本]

文献-算法
2025-01-12

文献--单细胞组学大模型之Genecompass

文献-算法
2024-12-15

文献--单细胞组学大模型之Geneformer

文献-算法
2024-12-14

torch模型组成模块参数查询、管理、保存

深度学习
2024-11-30

R-数据分析--tidyr表格操作

R可视化
2024-11-16

文献--单细胞组学大模型之CellPLM

文献-算法
2024-11-09

单机多卡torchrun分布式训练

深度学习
2024-11-09

文献--单细胞组学大模型之scBERT

文献-算法
2024-11-05

torch张量的维度操作

深度学习
2024-11-05

Json文件格式

计算机基础
2024-11-05

单细胞分析工具--scVI去除批次效应

scRNA-seq
2024-10-28

机器学习日志指标log记录

深度学习
2024-10-28

Flash Attention注意力优化

深度学习
2024-10-28

深度学习常规Config训练配置

深度学习
2024-10-28

GPU,CUDA以及Pytorch之间的关系

深度学习
2024-10-16

Pytorch-常用神经网络层-torch.nn

深度学习
2024-10-16

Pytorch-Dataset与Dataloader的使用.

深度学习
2024-10-16

Torchtext构建Vocab词表

深度学习
2024-10-16

Hugging Face(2)-Datasets库

深度学习
2024-10-16

Hugging Face(3)-Tokenizer库

深度学习
2024-10-16

Hugging Face(1)-NLP basic

深度学习
2024-10-16

单细胞分析工具--CELLxGENE数据库

scRNA-seq
2024-10-16

Python-装饰器Decorator

Python
2024-10-16

Python-Dunder双下划线特殊方法

Python
2024-10-05

UCSCXenaShiny V2简要教程

多组学
2024-09-29

文献--单细胞组学大模型之scGPT

文献-算法
2024-09-22

Snakemake流程搭建

Linux
2024-09-19

文献--前列腺癌基础学习

生物
2024-09-17

单细胞分析工具--Seurat5基础用法

scRNA-seq
2024-09-03

深度学习--GAN基础

深度学习
2024-08-24

D2L--第十一及十二章优化算法&多GPU并行

深度学习 D2L
2024-08-17

D2L--第十四及十五章BERT模型

深度学习 D2L
2024-08-17

D2L--第十章注意力机制与Transformer

深度学习 D2L
2024-08-11

D2L--第九章现代循环神经网络

深度学习 D2L
2024-08-11

D2L--第八章循环神经网络

深度学习 D2L
2024-08-04

D2L--第七章现代卷积神经网络

深度学习 D2L
2024-08-04

D2L--第六章卷积神经网络

深度学习 D2L
2024-07-28

D2L--第五章深度学习计算

深度学习 D2L
2024-07-28

D2L--第四章多层感知机

深度学习 D2L
2024-07-21

D2L--第三章线性神经网络

深度学习 D2L
2024-07-21

D2L--第二章预备知识

深度学习 D2L
2024-04-17

文献--ccRCC单细胞转录组

文献-组学
2024-04-17

文献--生信套路之肿瘤预后

文献-挖掘
2024-04-06

rhinoverse系列-shiny.router包

Shiny
2024-04-06

rhinoverse系列-rhino包

Shiny
2024-04-06

renv包环境可重复性

R
2024-03-31

Shiny-pkg-6-others

Shiny
2024-03-31

Shiny-pkg-5-bslib

Shiny
2024-03-31

Shiny-pkg-4-shinydashboardPlus

Shiny
2024-03-31

Shiny-pkg-3-shinydashboard

Shiny
2024-03-31

Shiny-pkg-2-shinyJS

Shiny
2024-03-31

Shiny-pkg-1-shinyWidgets

Shiny
2024-03-31

Shiny-basic-5-Module

Shiny
2024-03-31

Shiny-basic-4-Feedback

Shiny
2024-03-31

Shiny-basic-3-Reactive

Shiny
2024-03-31

Shiny-basic-2-Layout

Shiny
2024-03-31

Shiny-basic-1-IO

Shiny
2023-11-19

UCSCXenaShiny development tutorials(231119)

2023-08-13

shiny包开发网页APP进阶

Shiny
2023-08-07

单细胞分析工具--ShinyCell交互式展示单细胞数据

scRNA-seq
2023-07-09

R包purrr的函数编程

R tidyverse
2023-07-01

单细胞分析工具--COSG鉴定marker基因

scRNA-seq
2023-06-23

文献--浆细胞(Plasma cells)在膀胱癌(Bladder cancer)中的预后分析

文献-挖掘
2023-06-18

文献--基于泛癌scRNAseq的T细胞图谱整合分析

文献-组学
2023-06-17

R包NMF非负矩阵分解

机器学习
2023-06-17

富集通路可视化方式

转录组
2023-06-13

R-可视化--funkyheatmap绘制table热图

R可视化
2023-06-03

BayesPrism包根据scRNAseq预测Bulk细胞组成

转录组
2023-05-15

IOBR包肿瘤signature打分与免疫浸润分析

转录组
2023-05-12

UCSCXenaShiny包肿瘤数据分析可视化

多组学
2023-04-30

单细胞分析工具--sccoda细胞组成比较

scRNA-seq
2023-04-30

单细胞分析工具--sccode综合差异分析

scRNA-seq
2023-04-28

诺模图或列线图绘制分析

转录组
2023-04-22

R-可视化--ggsignif注释显著性

R可视化
2023-04-22

R-可视化--ggbeeswarm绘制蜂群图

R可视化
2023-04-22

单细胞分析工具--celldancer细胞速率分析

scRNA-seq
2023-04-20

肿瘤亚型分群工具ConsensusClusterPlus

转录组
2023-04-17

文献--髓鞘脱失与再生模型小鼠snRNAseq数据分析

文献-组学
2023-04-17

单细胞分析工具--scSTAR挖掘分组样本细胞亚型

scRNA-seq
2023-04-09

R-可视化--ggplot绘制散点图添加边际图

R可视化
2023-04-09

TCGA的SNV数据下载与maftools可视化

多组学
2023-04-02

生信相关网站数据库集锦

生信基础
2023-04-01

R-可视化--corrplot相关性绘图

R可视化
2023-04-01

文献-数据挖掘-肺腺癌相关基因对

文献-挖掘
2023-04-01

文献-数据挖掘-肾癌与凝血相关基因

文献-挖掘
2023-03-26

MuSiC包根据scRNAseq预测Bulk细胞组成

转录组
2023-03-25

Shell_Python_R脚本基础

R Python Linux
2023-03-20

化合物指纹与描述符生成系列工具

化合物
2023-03-19

ClusterGVis包绘制基因表达矩阵热图

转录组
2023-03-18

单细胞分析工具--Asgard单细胞药物重定向

scRNA-seq
2023-03-11

R-可视化--ggplot标注文本标签text&label

R可视化
2023-03-11

R-可视化--饼图与环图

R可视化
2023-03-11

单细胞分析工具--scCustomize包改进Seurat可视化

scRNA-seq
2023-03-06

单细胞分析工具--MARVEL单细胞可变剪切

scRNA-seq
2023-02-21

深度学习--VAE变分自动编码器

深度学习
2023-02-19

单细胞分析工具--Scissor表型相关亚群鉴定

scRNA-seq
2023-02-18

xCell与CIBERSORT等免疫浸润分析

转录组
2023-02-10

单细胞分析工具--MAST差异基因分析

scRNA-seq
2023-02-09

单细胞分析工具--NicheNet细胞通讯分析

scRNA-seq
2023-02-07

单细胞分析工具--基于文献的细胞类型注释marker

scRNA-seq
2023-02-05

文献--克罗恩肠炎疾病的大型单细胞图谱

文献-组学
2023-02-02

文献--immuCan肿瘤微环境单细胞数据库

文献-组学
2023-01-29

hugo+github搭建我的个人博客

计算机基础
2023-01-29

从RNAseq的fastq.gz提取表达矩阵

转录组
2023-01-29

survival包生存分析及glmnet包lasso回归

生信基础
2023-01-28

单细胞分析工具--DoubletFinder识别双细胞

scRNA-seq
2023-01-28

单细胞分析工具--cellphonedb细胞通讯分析

scRNA-seq
2023-01-26

单细胞分析工具--CytoTRACE轨迹分析

scRNA-seq
2023-01-26

单细胞分析工具--RNAvelocity速率分析

scRNA-seq
2023-01-25

单细胞分析工具--cellranger

scRNA-seq
2023-01-23

单细胞分析工具--scanpy基础用法(anndata,loom格式)

scRNA-seq
2023-01-22

基于Rstudio创建R包

R
2023-01-22

单细胞分析工具--SingleCellExperiment对象格式

scRNA-seq
2023-01-22

单细胞分析工具--多样本批次校正

scRNA-seq
2023-01-22

单细胞分析工具--细胞周期分析

scRNA-seq
2023-01-20

单细胞分析工具--SingleR细胞类型注释

scRNA-seq
2023-01-20

单细胞分析工具--infercnv拷贝数变异鉴定

scRNA-seq
2023-01-19

文献--hECA人类单细胞表达图谱平台

文献-组学
2023-01-19

单细胞分析工具--ECAUGT提取hECA数据

scRNA-seq
2023-01-16

R-可视化--桑基(sankey)与冲击(alluvial)图ggsankey

R可视化
2023-01-16

R-可视化--弦图chordDiagram

R可视化
2023-01-15

GSVA包单样本富集分析

转录组
2023-01-14

clusterProfiler包富集分析与可视化

转录组
2023-01-13

GSEA富集分析工具

转录组
2023-01-12

单细胞分析工具--Palantir轨迹分析

scRNA-seq
2023-01-12

单细胞分析工具--Seurat4基础流程

scRNA-seq
2022-12-18

文献--WGCNA发现的卵巢癌肿瘤相关成纤维细胞的预后模型

文献-挖掘
2022-12-11

文献--小鼠缺血性中风单细胞数据分析

文献-挖掘
2022-12-01

文献--椎间盘退行性疾病bulk与scRNA-seq数据挖掘

文献-挖掘
2022-11-13

文献--基于肝细胞癌M2样肿瘤巨噬细胞建立预后模型

文献-挖掘
2022-11-05

R-可视化-绘图颜色与画板的选择

R可视化
2022-11-05

R-可视化-ggplot绘制常规柱状图barplot

R可视化
2022-11-05

R-可视化-ggplot+ggpubr绘制箱图boxplot

R可视化
2022-10-30

文献--挖掘AD单细胞数据分析NK浸润

文献-挖掘
2022-10-22

MySQL初学

计算机基础
2022-10-09

化合物敏感度数据库GDSC_CTRL

化合物
2022-10-08

文献--肝癌空间转录组数据分析

文献-组学
2022-09-20

Python基础-(9)文本读写与pickle保存

Python
2022-09-19

Python-threading多线程

Python
2022-09-17

机器学习--自动机器学习工具autogluon

机器学习
2022-09-17

Python-lambda函数表达式

Python
2022-09-10

初识slurm基础操作

Linux
2022-09-10

R-可视化-韦恩图venn

R可视化
2022-09-04

R-可视化-拼图patchwork

R可视化
2022-09-04

机器学习基于sklearn(4)--常见回归任务学习器

机器学习
2022-09-04

机器学习基于sklearn(3)--常见分类任务学习器

机器学习
2022-09-04

机器学习基于sklearn(2)--交叉验证与超参数优化

机器学习
2022-08-28

图神经网络DGL-03同构图_边预测

深度学习
2022-08-28

图神经网络DGL-03同构图_边回归

深度学习
2022-08-28

图神经网络DGL-02同构图_节点分类

深度学习
2022-08-23

深度学习D2L--03--K折交叉验证的torch训练基础流程

深度学习 D2L
2022-08-23

机器学习基于sklearn(1)--sklearn基础

机器学习
2022-08-06

文献--乳腺癌单细胞转录组图谱

文献-组学
2022-07-31

图神经网络DGL-01-DGL基础

深度学习
2022-07-31

深度学习D2L--02--softmax多分类

深度学习 D2L
2022-07-31

深度学习D2L--01--线性回归

深度学习 D2L
2022-07-30

Python-可视化-pandas绘图

Python
2022-07-23

R-可视化-ggpubr包快速绘制点图、线图与柱状图

R可视化
2022-07-20

ChemmineR处理化合物信息的基础工具R包

化合物
2022-07-10

统计学-生信中常见统计指标

统计基础
2022-07-10

统计学基础--重抽样Bootstrap与置换检验permutation test

统计基础
2022-07-07

单细胞分析工具--hdWGCNA共表达网络

scRNA-seq
2022-07-06

文献--32种乳腺癌细胞系单细胞转录组图谱

文献-组学
2022-07-06

机器学习基于R包mlr3(14)--聚类-k均值

机器学习 mlr3
2022-07-03

R-可视化-ggplot2绘图基础

R可视化
2022-07-01

机器学习基于R包mlr3(4)--分类--朴素贝叶斯

机器学习 mlr3
2022-07-01

机器学习基于R包mlr3(3)--分类--LDA与QDA

机器学习 mlr3
2022-07-01

机器学习基于R包mlr3(2)--分类--逻辑回归.md

机器学习 mlr3
2022-06-30

机器学习基于R包mlr3(1)--分类--KNN

机器学习 mlr3
2022-06-26

机器学习基于R(0)--mlr3基本流程

机器学习 mlr3
2022-06-25

R-数据分析-reshape2表格长短转换

R
2022-06-18

文献--基于药物干扰转录组建立距离网络用于药物重定向

文献-算法
2022-06-18

机器学习基于R包mlr3(16)--聚类-EM混合分布

机器学习 mlr3
2022-06-18

机器学习基于R包mlr3(15)--聚类-层次聚类

机器学习 mlr3
2022-06-18

机器学习基于R(0)--mlr3基本流程 V2

机器学习 mlr3
2022-06-14

统计学基础--以T检验为例学习基于中心极限定理的假设检验

统计基础
2022-06-13

统计学基础--相关性与一致性

统计基础
2022-06-12

可视化-R--热图heatmap

R可视化
2022-06-11

差异分析R包-DESeq2+edgeR+limma

转录组
2022-06-10

文献--AD小鼠空间转录组数据分析

文献-组学
2022-06-10

统计学基础--统计描述指标与常见统计分布

统计基础
2022-06-09

统计学基础--二分类模型评价指标

统计基础
2022-06-07

Python数据科学-(2)Numpy数组(torch张量)

Python
2022-06-05

使用Seurat包分析空间转录组数据

scRNA-seq
2022-05-31

文献--基于通路富集的药物重定向(以AD药物为例)

文献-算法
2022-05-30

Python基础-(6)捕捉异常Error

Python
2022-05-29

Python基础-(5)类Class与实例Instance

Python
2022-05-28

人类基因组基础知识与下载查询

生信基础
2022-05-28

Python数据科学-(4)Matplotlib可视化

Python
2022-05-27

文献--synergyfinder包计算协同评价指标

文献-算法
2022-05-23

下载测序数据SRR与fastq.gz方式

转录组
2022-05-23

统计学基础--方差分析与卡方检验

统计基础
2022-05-22

shiny包开发网页APP基础

Shiny
2022-05-21

机器学习基于R包mlr3(13)--降维t-SNE与UMAP

机器学习 mlr3
2022-05-20

文献--从相关性网络中鉴定节点间的直接调控关系

文献-算法
2022-05-17

R语言的多线程循环语句

R
2022-05-17

使用igraph包进行网络结构分析与可视化

R包-网络分析
2022-05-17

矩阵相似性计算样本通路一致性

文献-算法
2022-05-15

Linux的parallel并行方法

Linux
2022-05-15

在Linux系统里部署Jupyter环境

Linux
2022-05-14

docker初学

计算机基础
2022-05-14

linux进程管理与后台运行

Linux
2022-05-14

Python基础-(2)列表、元组、字符串、字典

Python
2022-05-14

Python基础-(1)初识

Python
2022-05-12

机器学习基于R包mlr3(12)--降维--PCA

机器学习 mlr3
2022-05-10

R语言RSelenium爬虫.md

R
2022-05-10

Python数据科学-(3)Pandas表格

Python
2022-05-08

R-数据分析-dplyr表格操作

R tidyverse
2022-05-08

机器学习基于R包mlr3(11)--回归--kNN+随机森林+XGBboost

机器学习 mlr3
2022-05-07

机器学习基于R包mlr3(10)--回归--岭回归+LASSO回归+弹性网络

机器学习 mlr3
2022-05-06

MsigDB基因集数据库

生信基础
2022-05-06

文献--综合多种分析建立TNBC预后模型

文献-挖掘
2022-05-06

WGCNA基因加权共表达网络分析

转录组
2022-05-06

TCGAbiolinks包-TCGA数据下载与差异分析

转录组
2022-05-03

数据库--药物与药物靶点TTD

化合物
2022-04-30

从GEO下载芯片或RNAseq测序数据

转录组
2022-04-30

表达矩阵TPM,FPKM标准化

转录组
2022-04-29

基于PPI网络的靶点群距离预测药物组合

文献-算法
2022-04-28

文献--四逆散与非酒精性脂肪肝网药分析

文献-挖掘
2022-04-27

机器学习基于R包mlr3(9)--回归--GAM非线性回归

机器学习 mlr3
2022-04-26

050快捷键

计算机基础
2022-04-26

Python数据科学-(1)IPython的特点

Python
2022-04-22

window系统快速安装ubuntu子系统

计算机基础
2022-04-22

机器学习基于R包mlr3(8)--回归--线性回归

机器学习 mlr3
2022-04-21

CMap数据库整理与使用方法

化合物
2022-04-19

重启随机游走算法与RandomWalkRestartMH包

R包-网络分析
2022-04-17

Python基础-(8)常用基础模块Module

Python
2022-04-16

obabel化学小分子格式转换

化合物
2022-04-16

shell基础--grep等文本处理命令

Linux
2022-04-16

shell基础--tar.gz相关、gzip压缩与pigz多线程

Linux
2022-04-16

shell基础--find查找文件

Linux
2022-04-16

shell基础--变量名字符串操作

Linux
2022-04-16

R基础配置

R
2022-04-16

机器学习基于R包mlr3(6)--分类--决策树与随机森林

机器学习 mlr3
2022-04-16

正则表达式基础

计算机基础
2022-04-16

EnhancedVolcano包绘制火山图

转录组
2022-04-16

使用IsoformSwitchAnalyzeR包进行可变剪切分析

转录组
2022-04-16

使用clusterProfiler下载GO&KEGG通路基因

生信基础
2022-04-16

STRINGdb包下载蛋白PPI数据

多组学
2022-04-16

Refgenie下载参考基因组

多组学
2022-04-16

单细胞分析工具--pySCENIC转录因子分析

scRNA-seq
2022-04-16

单细胞分析工具--CellChat细胞通讯分析

scRNA-seq
2022-04-16

单细胞分析工具--monocle轨迹分析

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2022-04-16

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