使用clusterProfiler下载GO&KEGG通路基因
1、GO 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66...
生信基础
人类基因组基础知识与下载查询
一、基因组大小 （1）人类基因组主要由细胞核的23对染色体组成(核基因组)，还包括线粒体中的小DNA分子(线粒体基因组)。 （2）单倍体基因组大...
基因-蛋白-化合物ID转换
1、不同基因ID转换 1.1 org.Hs.eg.db包 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 library(dplyr) library(org.Hs.eg.db) keytypes(org.Hs.eg.db) # [1] "ACCNUM" "ALIAS" "ENSEMBL" "ENSEMBLPROT" "ENSEMBLTRANS" "ENTREZID" # [7] "ENZYME" "EVIDENCE" "EVIDENCEALL"...
survival包生存分析及glmnet包lasso回归
生存分析(survival analysis)的主要目的是发现与患者生存事件相关的指标因素，例如年龄性别、基因表达/突变等。如下学习相关基础知...
生信相关网站数据库集锦
1、HPA HPA：the Human Protein Atlas，由2003年来自瑞典的科研机构发起，旨在绘制综合性人类蛋白质图谱。 https://www.proteinatlas.org/ 蛋白质表达数据库，常见用途包括：...
MsigDB基因集数据库
官方介绍：https://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/ 下载界面：http://www.gsea-msig...