UCSCXenaShiny包肿瘤数据分析可视化
UCSCXenaShiny是基于集成了多种肿瘤数据库的UCSCXena平台,进行数据下载、分析、可视化的Shiny工具(以及同名R包),由上...
UCSCXenaShiny是基于集成了多种肿瘤数据库的UCSCXena平台,进行数据下载、分析、可视化的Shiny工具(以及同名R包),由上...
EnhancedVolcano包可根据差异分析结果,基于ggplot2绘图结构,方便地绘制美观的火山图,下面根据自己的理解小结下基本用法。 官...
IOBR包集signature打分与免疫浸润分析为一体的肿瘤数据分析工具,由南方医科大学南方医院廖旺军教授,曾东强博士等人于2021年7月发...
BayesPrism是由美国康奈尔大学Tin Yi Chu等人开发的R包工具,于2022年4月发表在Nature Cancer。简单来说,该方法使用...
(1)NMF是非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization)的缩写。它是将一个非负数据矩阵分解为两个非负矩阵的乘积,其...
https://mlr3book.mlr-org.com/ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 library(mlr3verse) library(tidyverse) tsks() #预置数据任务 lrns() #机器学习算法 msrs() #性能评价指标 as.data.table() 1. Task 任务 https://mlr3book.mlr-org.com/chapters/chapter2/data_and_basic_modeling.html 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 tsk() #预置数据任务 as.data.table(tsk()) tsk("mtcars") #...
1 2 library(mlr3verse) library(tidyverse) 1、Task训练数据与目的 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 ## 分类任务 task_classif = as_task_classif(data, target = "col_target") #根据预测结果又可分为:twoclass二分类, mul...
KNN–K近邻 1、KNN的步骤 (1)计算输入数据与训练数据的距离(一般欧几里得距离); (2)从训练集中,选取距离输入数据点最近的...
1、逻辑回归的算法理解 逻辑回归 = 线性回归 + Sigmoid函数 与线性回归相同的是同样需要学习变量的权重(系数)与偏置(截距);与线性回归不同的...
1、概述 LDA与QDA可以简单理解为有监督的降维,将多个预测变量信息压缩成少数(类别数-1)新的预测变量。 每一个新的预测变量称之为判别函数,...