单细胞分析工具--DoubletFinder识别双细胞
R包DoubletFinder可用于检测基于Droplet单细胞测序技术(10X)的双细胞。如下简单学习识别原理以用法。 原始论文：https...
📖 生信数据分析--分析流程，工具包等
单细胞分析工具--MAST差异基因分析
MAST，全称Model-based Analysis of Single-cell Transcriptomics，是2015年于Genome Biology发表的R包工具，主要用于单...
单细胞分析工具--Scissor表型相关亚群鉴定
Scissor是2022年发表在Nature Biotechnology的一个单细胞数据分析工具包。该包通过纳入Bulk表达与表型数据，试图分...
单细胞分析工具--MARVEL单细胞可变剪切
R包MARVEL是由牛津大学MRC Weatherall分子医学研究所团队开发的，用于分析单细胞水平的可变剪切事件。相关文章于2023年1月在...
单细胞分析工具--scCustomize包改进Seurat可视化
scCustomize包由来自波士顿儿童医院/哈佛医学院的博士后Samuel E. Marsh编写。该包基于Seurat，提供了若干便捷、高效的可...
单细胞分析工具--Asgard单细胞药物重定向
来自密歇根大学医学院的计算医学与生物信息学部的LanaX.Garmire(拉娜·加米尔)团队近日于Nature Communication发表...
单细胞分析工具--基于文献的细胞类型注释marker
根据平时的文献阅读，汇总前人注释单细胞数据的细胞类型所使用的marker gene，以供后续研究参考。（持续更新） 1、Tumor B cell：C...
单细胞分析工具--scSTAR挖掘分组样本细胞亚型
scSTAR是由复旦大学附属中山医院郝洁研究员等人开发的单细胞分析工具包，于2023年2月发表在Briefings in Bioinformati...
单细胞分析工具--NicheNet细胞通讯分析
原始论文：https://www.nature.com/articles/s41592-019-0667-5 官方手册：https://git...
单细胞分析工具--celldancer细胞速率分析
cellDancer是美国休斯顿卫理公会研究所的助理教授Guangyu Wang团队开发的RNA速率分析新工具，于2023年4月发表于natu...