统计学基础--统计描述指标与常见统计分布
统计的对象是数据，其中会涉及到不同类型的数据；统计的目的是描述，描述一组数据的分布特征、两组至多组数据之间的关系。 1、数据分类 根据数据特点，...
📖 科研基础 -- 读文献、看教材
统计学基础--以T检验为例学习基于中心极限定理的假设检验
统计学常用样本数据推断总体结果，或者说使用样本统计量推断总体参数。包含如下意义： （1）对于样本数据，根据问题的不同，会有不同的形式。例如单纯...
统计学基础--方差分析与卡方检验
方差分析(analysis of variance)可以简单的理解为多组间的均值比较。例如A班、B班、C班、D班的考试成绩均值是否存在显著差异。方...
统计学基础--相关性与一致性
一、相关性 1、线性相关系数 （1）线性相关系数用于描述多个样本数据中两个变量之间的线性相关的程度。 变量通常为连续型变量； 两个变量一般为描述样本...
统计学基础--二分类模型评价指标
1、混淆矩阵相关指标 假设某医生对100个挂号的人进行某疾病的判断，具体情况如下 前提已知这100人的真实患病情况：60人患病，40人健康 医生根...
统计学基础--重抽样Bootstrap与置换检验permutation test
重抽样本质上是从观测数据中反复抽取数据，有两种不同用法 1、Bootstrap （1）Bootstrap的核心是有放回的抽样，常用于估计统计量(...
统计学-生信中常见统计指标
1、KS统计量 Kolmogorov-Smirnov Tests Gene Set Enrichment Analysis https://github.com/franapoli/signed-ks-test 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 source("signed-ks-test.R") # c("two.sided", "less", "greater") ks = ks.test.2(c(2,10,11,20), 1:100, alternative = "greater") # Two-sample Kolmogorov-Smirnov test # data: c(2, 10, 11, 20) and 1:100 # D^+ = 0.8, p-value = 0.007277 # alternative hypothesis: the CDF of x lies above that of y...
文献--AD星形胶质与小胶质细胞的单细胞数据分析
AD星形胶质细胞与小胶质细胞的snRNA-seq数据分析 Diverse human astrocyte and microglial transcriptional responses to Alzheimer’s pathology Acta Neuropathologica (2022) 143:75–91 IF=17 https://doi.org/10.1007/s00401-021-02372-6 1、测序样本 24...
文献--AD小鼠空间转录组数据分析
Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer’s Disease Cell. 2020 Aug 20 | IF=41.5 DOI: 10.1016/j.cell.2020.06.038 这是关于AD的第一次空间转录组学的相关研究。如下为该文章中涉及空间转录组分析部分的简要笔记，具体可参看原...
文献--挖掘AD单细胞数据分析NK浸润
Expression of Immune Related Genes and Possible Regulatory Mechanisms in Alzheimer’s Disease doi: 10.3389/fimmu.2021.768966 05 November 2021 核心结论：AD病人外周血中的NK细胞浸润到大脑中参与AD病理过程的免疫反应。 1、公共数...