Linux的parallel并行方法
我对于parallel并行的简单理解即同时执行多个命令语句。尽管目前很多生信软件支持多线程运行(一条命令语句内),但并不是设置的越多就越快,比如trim_galore命令建议对于一对fastq文件,不超过8个线程。因此,如果有多个文件需要处理,想尽可能利用计算机几十个线程的资源,可以使用parallel。 ...
我对于parallel并行的简单理解即同时执行多个命令语句。尽管目前很多生信软件支持多线程运行(一条命令语句内),但并不是设置的越多就越快,比如trim_galore命令建议对于一对fastq文件,不超过8个线程。因此,如果有多个文件需要处理,想尽可能利用计算机几十个线程的资源,可以使用parallel。 ...
1、shell脚本 1.1 脚本执行 (1)命令行直接执行 如下示例:脚本第一行设置脚本解释器的路径,如写错或没写,系统会调用默认解释器执行。然后在运行脚本时,需要先赋予可执行权限。(下同) ...