BayesPrism包根据scRNAseq预测Bulk细胞组成
BayesPrism是由美国康奈尔大学Tin Yi Chu等人开发的R包工具，于2022年4月发表在Nature Cancer。简单来说，该方法使用单细胞RNA-seq作为先验信息，通过估计批量样本中细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达的联合后验分布。P(θ,Z|X,ϕ)，参数概念如下 ...
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MAGeCK-VISPR质控分析CRISPR测序数据
参考 https://bitbucket.org/liulab/mageck-vispr MAGeCK-VISPR：https://doi.org/10.1186%2Fs13059-015-0843-6 1. 安装环境 1 2 3 conda create -n mageck-vispr python=3.7 conda activate mageck-vispr conda install -c bioconda -c conda-forge mageck-vispr 经过实际操作，部分源代码需要修改 ...